Eggman construit un robot géant pour détruire Sonic. Mais rien ne se passe comme prévu.
Sonic trébuche sur une vieille armure mecha. Ca le rend beaucoup plus puissant mais également dépendant, il commence à changer.
Knuckles devient amnésique lors d'une bataille contre Eggman. Quand il découvre qu'il est le dernier de son espèce, il essaie de se trouver une famille d'accueil.