La vie de Nathan, un jeune garçon en CM2, bascule quand il rencontre par hasard Whisper, un valet surnaturel. Nathan découvre un nouveau monde peuplé de Yo-kai, des esprits magiques, dont Jibanyan, un chat insolent.

Nathan enquête sur une mystérieuse créature qui aurait été aperçue dans la rivière de la ville. Il rencontre également Toutouïe, un Yo-kai qui pousse ses victimes à révéler des secrets embarrassants.

Après les cours, c'est l'heure de faire le ménage en classe. Rémi et Matthieu se disputent la serpillière ! Les deux garçons sont tous les deux trop fiers pour laisser un autre passer la serpillière. Tout de même, c'est étrange de se disputer pour si p...

À cause de Grattoptère, Nathan n'arrive pas à dormir. Il est sans cesse dérangé par un moustique. C'est alors qu'apparaît Robonyan F, venu du futur.